29 Nisan’da Ankara merkezli bir soruşturma gerekçe gösterilerek bazı kentlerde evlere baskın düzenlendi. Baskınlarda aralarından Mezopotamya Ajansı editörü Sedat Yılmaz ve DFG Eşbaşkanı Dicle Müftüoğlu’nun bulunduğu birçok kişi gözaltına alındı. Yılmaz ve Dicle Müftüoğlu tutuklandı (29 Nisan)
Ankara Cumhuriyet Başsavcılığı iki gazeteciyle birlikte soruşturma içinde yer alan 19 kişi (beşi tutuklu) hakkında iddianame hazırladı. Savcılık iddianameyi Ankara 28. Ağır Ceza Mahkemesi’ne gönderdi (21 Temmuz).
14 Aralık’ta davanın ilk duruşması görüldü. Ankara’da Sincan Cezaevinde tutulan Yılmaz, Diyarbakır 4. Ağır Ceza Mahkemesindeki duruşmaya getirildi. Yılmaz savunma yaptı, iki gizli tanık dinlendi. Ara kararını açıklayan mahkeme Yılmaz’ın tahliyesine hükmetti (14 Aralık).
Diyarbakır 4. Ağır Ceza Mahkemesi, “örgüt üyeliği (TCK 314/1)” ve “silahlı terör örgütü kurmak yönetmek (TCK 314/2)” suçlamasıyla 7 ay tutuklu kalan Mezopotamya Ajansı editörü ve BİA Çocuk Kitaplığı yazarı Sedat Yılmaz hakkında verdiği beraat kararının gerekçesini açıkladı. Mahkeme, gizli tanıkların beyanlarının Yılmaz’ın örgüt üyesi olduğunu kesin şekilde ortaya koymaya yeterli olmadığını, sanığın soyut iddia dışında her türlü şüpheden uzak cezalandırmaya yeterli, kesin, somut ve inandırıcı delil elde edilemediğinden beraatına karar verdiğini açıkladı (11 Mart)